El control de la Calidad General se realiza en las 75 estaciones integradas en la Red COCA, ubicadas en tramos de diversas características (cabecera, tramos medios, aguas abajo de los vertidos más significativos) con el objeto de tener una visión global y representativa de la calidad de las aguas en el conjunto de la cuenca. A la hora de condensar la información recogida en un único valor numérico que refleje la calidad del agua se ha venido usando un índice numérico denominado Índice de Calidad General (ICG) . Este índice fue propuesto por Mingo Magro en 1981 y sus características, pautas de muestreo asociadas y método de cálculo se establecen en el libro "La vigilancia de la contaminación fluvial" (Mingo Magro J., 1981, DGOH/MOPU). El ICG se obtiene por medio de una fórmula matemática que pondera las calidades obtenidas para 23 variables físico-químicas obteniéndose un resultado numérico entre 0 y 100, representando 100 la mejor calidad deseable y 0 la peor. El valor 60 correspondería a la calidad mínima aceptable.
En función del valor numérico del ICG resultante se asigna una calidad al agua según la tabla siguiente:
- Entre 100 y 90: Calidad Excelente.
- Entre 90 y 80: Calidad Buena.
- Entre 80 y 70: Calidad Intermedia.
- Entre 70 y 60: Calidad Admisible.
- Apartir de 60: Calidad Inadmisible.

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