Este control se realiza en aquellas estaciones cuyos tramos asociados están definidos como de interés para la vida piscícola. La Red ICTIOFAUNA o Red de control de la vida piscícola está formada por un total de 56 estaciones, seleccionadas entre las que presentan una mayor riqueza piscícola. 21 de ellas están asociadas a los tramos designados por el ICONA como "zonas piscícolas declaradas de interés para la protección de la vida piscícola en el Estado Español" en su estudio "Peces continentales españoles. Inventario y clasificación de zonas fluviales" (ICONA, 1991). Los 21 tramos están seleccionados por requerir protección para asegurar la conservación de la ictiofauna continental, especialmente de la más amenazada, y trienalmente se informa a la UE sobre el estado de las 21 estaciones asociadas a estos tramos. El resto de estaciones de la Red Ictiofauna están asociadas a "zonas piscícolas de interés regional", por su estado de conservación o interés pesquero. Aunque no se necesita informar sobre ellas a la UE, el control que se hace en ellas es similar al de éstas. El cálculo de la aptitud piscícola se realiza de acuerdo a lo estipulado en la Directiva 2006/44/CE, sobre la calidad de las aguas continentales que requieren protección o mejora para ser aptas para la vida de los peces. La transposición de la misma se ha realizado en el Anexo nº 3 del Real Decreto 927/1988, donde se indican los parámetros a controlar y los valores exigibles; y en la O.M. de 16/12/88, donde se indican los métodos y frecuencia de análisis. La frecuencia de muestreo es mensual para todas las estaciones de la red piscícola. Según este cálculo las aguas se dividen en tres categorías: salmonícolas, ciprinícolas y no aptas; siendo las exigencias mayores para las aguas en las que habitan especies salmonícolas frente a aquellas establecidas para especies ciprinícolas. El cálculo de aptitud sigue unas pautas similares a las del control prepotable, exigiéndose el cumplimiento en un 95 % de las muestras de unos valores límite para cada parámetro y categoría.
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